Odsjek za transfuziju obavlja sljedeće djelatnosti:
Prijem davalaca krvi, pregled i odlučivanje o davanju krvi i dozi
Kontrola rada na uzimanju krvi davalaca i prihvatu davalaca
Izbor krvi za izdvajanje komponenata, sortiranje, centrifugiranje i izdvajanje komponenata, kriokonzervacija krvnih stanica, kontrola kvaliteta i sterilnosti krvnih  pripravaka
Davanje mišljenja o upotrebljivosti krvnih pripravaka i lijekova od krvi
Određivanje krvnih grupa, eritrocitnog fenotipa
Ispitivanje iregularnih antitijela, testiranje krvi davalaca i pacijenata na sifilis, AIDS, markere hepatitisa itd.
Praćenje posttransfuzijskih reakcija i prevencija.

Šef odsjeka: dr. Elmedina Sarajlić, specijalista transfuziologije